医用手术室净化工程因生产和建筑的性，在火灾发生和危险方面和其他般厂房有着显著的区别。由于医用手术室净化工程内的生产工艺对工程密闭性能有着的要求，所以导致了医用手术室净化工程可能存在的几种火灾危险性，这几种危险性在日常的运行期间我们都要注意。
、火灾危险源多，火灾发生概率高
在医药、化工、电子等行业，以生产工序或生产流程的流水作业要求来划分功能的情况比较突出，这使某些危险工序或危险设备直接影响到建筑和人员的。是些使用原料或生产过程中产生的中间产品带有易燃易爆危险性的，无法从医用手术室净化工程的建筑构造或建筑布局中加以范，使得医用手术室净化工程的火灾危险性大大增加。
二、洁净区域大，火分隔困难
随着现代工业是电子工业类的飞速发展以及洁净技术的不断新，洁净区的面积也不断增大。如某芯片生产企业根据工艺需求洁净区面积达近十万平方米，穿孔楼板使工厂洁净区与原料设备区融为体，洁净区又与送回风井道体化设计，达二十余米。对于此类超大型的医用手术室净化工程厂房，水平垂直火分区分隔的设置困难重重。当发生火灾时，火灾产生的烟尘易蔓延至整个厂区，造成多方面性的损害。
三、室内迂回曲，人员疏散困难
随着洁净区面积的不断增大，对空气悬浮粒子浓度控制要求的不断高，医用手术室净化工程内工艺措施、除尘尘设施也不断增加。厂内走廊、通道的布置均要先工艺的要求，使得医用手术室净化工程内平面布置迂回曲，人员疏散困难。大部分医药、电子、食品类洁净厂房属于劳动密集型厂房，是包装车间、装配车间等，大多是车间小、人员多，发生火灾也易造成群群伤。
四、建筑结构密闭，排烟扑救困难
为医用手术室净化工程的医用手术室净化度要求和节约能耗，生产区往往不设外窗或设数量较少的固定窗，生产空间保持结构密闭，旦发生火灾，热量难以散发，烟气难以排出，使得人员疏散和灭火救援火场排烟越发困难。部分医用手术室净化工程的保温材料在火灾时释放出的有毒气体被引入封闭的洁净厂房，也给人员疏散和火灾扑救带来大的困难。
五、生产工艺，次生灾害控制困难
部分医用手术室净化工程由于生产生物活性物质，旦发生火灾，不要控制、扑灭火灾，还要控制次生灾害的产生。旦控制次生灾害措施不当，造成环境污染的后果将远远大于火灾造成的后果。
